Маленькие зелёные человечки

В прологе эпизода Фокс Малдер рассказывает историю программы "Вояджер" Национального управления по воздухоплаванию и исследованию космического пространства и ныне несуществующей программы прослушивания высокочастотных электромагнитных сигналов, которые были разработаны для поисков внеземных форм жизни в дальнем космосе. На закрытой обсерватории в Аресибо (Пуэрто-Рико), использовавшейся для отправки посланий в космос, внезапно активируется оборудование, получившее ответ от внеземного разума.

Со времени закрытия "Секретных материалов" ФБР разлучило агентов Малдера и Скалли. Бывшие коллеги тайно встречаются на парковке отеля "Уотергейт". Малдер рассказывает, что ему поручили электронную слежку за мошенниками. Скалли удивляется тому, что Малдер как будто бы потерял интерес к "Секретным материалам" и не желает с ней общаться. Малдер признаётся, что после убийства Глубокой Глотки начал терять свою веру в паранормальные явления. Быть просто свидетелем происходящего недостаточно, ему необходимы вещественные доказательства. Скалли напоминает о его сестре Саманте, похищенной в детстве инопланетянами, однако Малдер начинает сомневаться в реальности и этого события. Скалли уходит, убеждая его не сдаваться. Малдер же погружается в детские воспоминания об исчезновении сестры.

Вскоре Малдера вызывают на встречу с новым союзником – сенатором Ричардом Мэтсоном. Мэтсон предлагает агенту поехать в Аресибо, где тот сможет продолжить свои поиски истины, а сенатор, в свою очередь, постарается задержать команду Голубых беретов, которую через 24 часа отправят на уничтожение свидетельств приземления НЛО. Малдер отправляется в Пуэрто-Рико на спутниковую станцию. Там он обнаруживает перепуганного местного жителя Хорхе, который рисует пришельцев и утверждает, что видел их. Тем временем Скалли, обеспокоенная исчезновением Малдера, пытается его разыскать. Просматривая список вылетавших из Вашингтона, она обнаруживает пассажира, отправившегося в Пуэрто-Рико под студенческой кличкой Малдера.

Малдер находит сигнал, который, возможно, является посланием внеземного разума. Во время шторма Хорхе пугается и выбегает на улицу. Малдер бросается следом за ним и находит испанца умершим от страха. Скалли едет в аэропорт, чтобы вылететь в Пуэрто-Рико, но понимает, что за ней следят. Ей удаётся избавиться от преследователей. Тем временем Малдер обследует тело Хорхе, однако комната приходит в движение, а в открытой двери появляется фигура пришельца. На следующее утро Скалли будит Малдера, тот бросается снимать показания приборов и искать записи сигналов – доказательства существования пришельцев, которые он искал так долго. Однако вскоре прибывает команда Голубых беретов, и парочке приходится спасаться бегством, забрать с собой они успели всего одну бобину.

По возвращении в Вашингтон Малдер получает выговор от Уолтера Скиннера и Курильщика за своевольную отлучку. Малдер заявляет, что, хотя и заслуживает наказания, но по порученным ему делам было найдено множество улик, к которым не было проявлено никакого внимания. Также Малдер заявляет, что даже его отсутствие прошло бы незамеченным, если бы его телефон не прослушивался Скиннером. Скиннер требует, чтобы Курильщик вышел и решает не наказывать Малдера. Изучая добытую плёнку, Малдер обнаруживает, что информация на ней стерта. Скалли предполагает, что причиной этого может являться скачок напряжения во время грозы.